OEI được thành lập vào năm 1949 như một cơ quan quốc tế, Văn phòng Giáo dục Mỹ Latinh, là kết quả của Hội nghị Giáo dục Mỹ Latinh đầu tiên ở Madrid. Năm 1954, đại hội lần thứ hai được tổ chức tại Quito, nơi nó được quyết định rằng ĐTM sẽ trở thành một tổ chức liên chính phủ của các quốc gia có chủ quyền. Vào ngày 15 tháng 3 năm 1957, tại Đại hội Giáo dục lần thứ ba tại Santo Domingo, các đạo luật đầu tiên của OEI đã có hiệu lực cho đến năm 1985.

Năm 1979, đại hội lần thứ tư gặp nhau tại Madrid; vào năm 1983, đại hội lần thứ năm diễn ra tại Lima. Vào tháng 5 năm 1985, một cuộc họp bất thường của đại hội được tổ chức tại Bogotá, nơi nó được quyết định đổi tên OEI thành tên hiện tại của nó (giữ nguyên từ viết tắt và mở rộng các mục tiêu của nó); Đại hội Giáo dục Mỹ Latinh trở thành Đại hội đồng. Tại cuộc họp hội đồng chỉ thị tháng 12 năm 1985 tại Panama, các thành viên của nó đã đồng ý với các quy chế hiện hành về ĐTM, thay thế văn bản năm 1957 và phê duyệt các quy định của tổ chức. Kể từ Hội nghị thượng đỉnh Ibero-Mỹ năm 1991 tại Guadalajara, OEI đã thúc đẩy các hội nghị của các bộ trưởng giáo dục và thực hiện các chương trình giáo dục, khoa học và văn hóa được giao cho nó.